Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL4Q9C0H6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms