Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms