Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms