Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms