Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BARHL1Q9BZE3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms