Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D2Q9BYX2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TBC1D2Q9BYX2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms