Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCO2Q9BYV7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms