Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC2Q9BYS8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms