Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms