Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REPIN1Q9BWE0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REPIN1Q9BWE0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms