Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS2Q9BVG9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms