Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms