Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM43Q9BTV4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms