Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms