Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms