Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms