Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM175Q9BSA9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms