Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms