Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TM2D3Q9BRN9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TM2D3Q9BRN9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TM2D3Q9BRN9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TM2D3Q9BRN9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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TM2D3Q9BRN9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TM2D3Q9BRN9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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