Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms