Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms