Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM47Q9BQJ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms