Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms