Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms