Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD5Q99666 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms