Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCAF11Q99590 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms