Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms