Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms