Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms