Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms