Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms