Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms