Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP47Q96K76 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms