Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms