Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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