Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms