Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms