Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms