Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms