Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS3Q969F9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms