Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms