Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms