Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms