Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX38Q92620 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms