Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms