Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms