Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms