Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C15orf40Q8WUR7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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