Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms