Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELBQ8NG08 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms